Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms