Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snapc3Q9D2C9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snapc3Q9D2C9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Snapc3Q9D2C9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Snapc3Q9D2C9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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