Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms