Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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