Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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