Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rab3bQ9CZT8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab3bQ9CZT8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms