Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms