Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rprd1bQ9CSU0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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