Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms