Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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