Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms