Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn6Q99PL6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms