Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln4Q99NB8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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