Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ms4a4dQ99N05 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ms4a4dQ99N05 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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