Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tdrd1Q99MV1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tdrd1Q99MV1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tdrd1Q99MV1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tdrd1Q99MV1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms