Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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