Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms