Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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