Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms