Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb6Q922F4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb6Q922F4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms