Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms