Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc115Q8VE99 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc115Q8VE99 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms