Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgms1Q8VCQ6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgms1Q8VCQ6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms