Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Top1mtQ8R4U6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Top1mtQ8R4U6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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