Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab11fip5Q8R361 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab11fip5Q8R361 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms