Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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