Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm48Q8K2X2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms