Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf13Q8K2W6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms