Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trappc12Q8K2L8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc12Q8K2L8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms