Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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