Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

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Length 1,266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms