Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc17Q8CE13 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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