Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms