Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms