Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgam5Q8BX10 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms