Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm4aQ8BW72 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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