Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep55Q8BT07 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep55Q8BT07 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep55Q8BT07 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep55Q8BT07 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep55Q8BT07 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep55Q8BT07 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms