Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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