Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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