Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek5Q7TSC3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nek5Q7TSC3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms