Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS7

Asic4, Acid-sensing ion channel 4, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic4Q7TNS7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asic4Q7TNS7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms