Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms