Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Smim12Q78RX3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms