Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Msrb2Q78J03 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msrb2Q78J03 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms