Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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