Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1cQ76I25 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms