Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms