Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms