Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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