Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms